這涉及通過(guò)測(cè)量關(guān)鍵生物標(biāo)志物/抗原的存在與否以及細(xì)胞的FSC及SSC特性來(lái)分析白細(xì)胞。
免疫表型分析的可靠性取決于幾個(gè)因素,包括樣品的質(zhì)量以及染色和處理試劑、儀器性能以及分析的質(zhì)量。
Cell Type | Common Identifying Biomarker |
B-lymphocytes | CD19, CD20, CD22, CD79a, immunoglobulin light chains (κ or λ) |
T-lymphocytes | CD2, CD3, CD5, CD7, CD4 or 8 |
Myeloid | MPO, CD13, CD33 |
Natural Killer | CD16, CD56 |
Immature Precursors | CD34, CD117, TdT |
Platelets | CD41, CD42b, CD61 |
Red Blood Cells | CD235a |
Monocytic differentiation markers | C11b, CD14, CD33, HLA-DR |
表1. 用于免疫表型應(yīng)用的基本標(biāo)記。 流式細(xì)胞術(shù)現(xiàn)在是用于譜系評(píng)估、惡性腫瘤成熟表征、異質(zhì)性和亞群定量的首選方法。??
腫瘤研究的實(shí)驗(yàn)通常包括三個(gè)部分:臨床研究、細(xì)胞研究和動(dòng)物實(shí)驗(yàn)。
臨床研究,首先要考慮的是可以收集到的病例數(shù)以及收集的難度。除了記錄好臨床數(shù)據(jù),根據(jù)實(shí)驗(yàn)的內(nèi)容,需要對(duì)臨床樣品進(jìn)行合適的保存和記錄。如免疫組化、免疫熒光樣品,需要用PBS洗去血液后,固定常溫保存。RT-qPCR和WB樣品,則需要速凍保存。務(wù)必先弄清楚樣品保存條件后,再開(kāi)展工作,否則可能白辛苦。而且由于臨床樣品收集是非常省時(shí)的工作,一旦錯(cuò)誤收集樣品,可能導(dǎo)致這部分實(shí)驗(yàn)無(wú)法在特定時(shí)間點(diǎn)前完成。
細(xì)胞實(shí)驗(yàn),首先需要查收是否有可靠來(lái)源的細(xì)胞株,細(xì)胞株是否易于培養(yǎng)和實(shí)驗(yàn)。設(shè)計(jì)好細(xì)胞實(shí)驗(yàn)內(nèi)容后,需要確定基因在細(xì)胞的表達(dá)水平,以確定是過(guò)表達(dá)還是沉默該基因。
如果要做裸鼠成瘤實(shí)驗(yàn),那么在選擇細(xì)胞時(shí),還需要確定細(xì)胞的成瘤性。
總之,在您開(kāi)始長(zhǎng)達(dá)1年甚至數(shù)年的研究之前,我建議您,先花1-2個(gè)月做這些前期工作。
]]>轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究包括mRNA、lncRNA、circRNA、小RNA測(cè)序,差異分析。
LongRNA-seq是一種全面檢測(cè)細(xì)胞和組織長(zhǎng)片段RNA(200nt) 的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序方法,包括線性的mRNA和lncRNA分子,以及環(huán)狀RNA,可準(zhǔn)確高效揭示轉(zhuǎn)錄組的表達(dá)全貌,是非編碼RNA的重要研究技術(shù)。
lncRNA是一類(lèi)長(zhǎng)度大于200nt,無(wú)典型開(kāi)放閱讀框(ORF)的RNA,其數(shù)量遠(yuǎn)高于編碼蛋白質(zhì)的mRNA。它們的基因背景很豐富,可以是由啟動(dòng)子、增強(qiáng)子起始的序列,基因內(nèi)含子,RNA的反義鏈,亦或是基因之間的序列等。研究發(fā)現(xiàn)lncRNA可在表觀遺傳學(xué)水平(包括DNA 甲基化、組蛋白修飾、染色質(zhì)重構(gòu))、轉(zhuǎn)錄及轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)節(jié)基因的表達(dá),從而參與各種基本生命活動(dòng)和疾病的發(fā)生發(fā)展過(guò)程。
與傳統(tǒng)的線性RNA(linear RNA,含5’和3’末端)不同,circRNA分子呈封閉環(huán)狀結(jié)構(gòu),不受RNA外切酶影響,表達(dá)更穩(wěn)定,不易降解。在功能上,近年的研究表明,circRNA分子富含miRNA結(jié)合位點(diǎn),在細(xì)胞中起到miRNA海綿( miRNA sponge)的作用,進(jìn)而解除miRNA對(duì)其靶基因的抑制作用,升高靶基因的表達(dá)水平;這一作用機(jī)制被稱(chēng)為競(jìng)爭(zhēng)性?xún)?nèi)源RNA(ceRNA)機(jī)制。通過(guò)與疾病關(guān)聯(lián)的miRNA相互作用, circRNA在疾病中發(fā)揮著重要的調(diào)控作用。而最新的研究發(fā)現(xiàn),還存在大量的環(huán)形RNA可作為信使RNA來(lái)編碼蛋白,這些環(huán)形信使RNA通過(guò)一種常見(jiàn)的RNA甲基化修飾m6A,來(lái)驅(qū)動(dòng)非帽依賴(lài)性的翻譯機(jī)制來(lái)合成蛋白質(zhì)。
RNA m6A檢測(cè)
真核基因通常產(chǎn)生多種RNA異構(gòu)體(isoform),可以產(chǎn)生功能上不同的蛋白質(zhì)變體。傳統(tǒng)二代測(cè)序?qū)嶋H上是一種短讀長(zhǎng)RNA-seq,難以獲得完整的轉(zhuǎn)錄本,無(wú)法體現(xiàn)異構(gòu)體的多樣性。
基于Oxford Nanopore公司的納米孔測(cè)序平臺(tái),直接對(duì)RNA進(jìn)行測(cè)序,具有長(zhǎng)讀長(zhǎng)的優(yōu)勢(shì),提高對(duì)異構(gòu)體的檢測(cè),還能直接檢測(cè)m6A、m5C等核酸修飾,在可變剪切研究方面具有獨(dú)特的優(yōu)勢(shì)。一次測(cè)序,即可滿(mǎn)足多項(xiàng)表觀遺傳轉(zhuǎn)錄組研究需求,大大提升研究的高度、深度、準(zhǔn)確性、效率,尤其適用于多組學(xué)分子機(jī)制及珍貴的臨床樣本研究。
ONT優(yōu)勢(shì):
1. 作為長(zhǎng)讀長(zhǎng)測(cè)序技術(shù),能減少短讀長(zhǎng)測(cè)序打斷后重新拼接帶來(lái)的歧義,結(jié)果準(zhǔn)確度更高、更可信;
2. 能夠直接對(duì)RNA進(jìn)行測(cè)序,避免逆轉(zhuǎn)錄和PCR擴(kuò)增導(dǎo)致的RNA修飾信息缺失;
3. 可以直接檢測(cè)m6A等堿基修飾,配合優(yōu)化的算法,獲得無(wú)損的m6A單堿基分辨率圖譜;
4. 一次測(cè)序,多套數(shù)據(jù):轉(zhuǎn)錄組圖譜、m6A修飾圖譜、異構(gòu)體、可變剪切情況,節(jié)省珍貴的臨床樣本,節(jié)省樣本準(zhǔn)備時(shí)間和精力,且保持了樣本的統(tǒng)一性。
蛋白質(zhì)組學(xué)
iTRAQ和TMT是分別由美國(guó)AB Sciex公司和Thermo公司研發(fā)的多肽體外標(biāo)記定量技術(shù),采用8種或10種同位素標(biāo)簽,通過(guò)特異性標(biāo)記多肽的氨基酸基團(tuán)同,一次上機(jī)可實(shí)現(xiàn)8種或10種不同樣本中蛋白質(zhì)的相對(duì)定量,是近年來(lái)定量蛋白質(zhì)組學(xué)常用的高通量篩選技術(shù)。
iTRAQ和TMT原理類(lèi)似,以iTRAQ試劑為例,該試劑結(jié)構(gòu)由報(bào)告基團(tuán)、中性平衡基團(tuán)和反應(yīng)基團(tuán)三部分組成。不同報(bào)告基團(tuán)及其相對(duì)應(yīng)平衡基團(tuán)的質(zhì)量和都相同,而反應(yīng)基團(tuán)能與賴(lài)氨酸ε氨基和所有肽鏈的氨基末端連接,可標(biāo)記所有氨基酸。
不同標(biāo)記試劑與來(lái)源于不同樣品胰酶消化后的肽段結(jié)合,,經(jīng)過(guò)色譜分離,并通過(guò)一級(jí)質(zhì)譜和二級(jí)質(zhì)譜。平衡基團(tuán)在二級(jí)質(zhì)譜時(shí)發(fā)生中性丟失,而報(bào)告基團(tuán)在二級(jí)質(zhì)譜低質(zhì)量區(qū)域產(chǎn)生多個(gè)報(bào)告離子,其信號(hào)強(qiáng)度分別代表該標(biāo)記樣品的表達(dá)量,根據(jù)報(bào)告離子的峰面積計(jì)算同一蛋白質(zhì)同一肽段在不同樣品間的比值,從而實(shí)現(xiàn)蛋白的相對(duì)定量。
定量PCR(Quantitative PCR, qPCR),也稱(chēng)實(shí)時(shí)PCR(Real-time PCR)或者實(shí)時(shí)定量PCR,是指借助熒光染料或熒光標(biāo)記的特異性探針,在PCR指數(shù)擴(kuò)增期間實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)PCR反應(yīng)體系中的熒光信號(hào)強(qiáng)度的變化,從而對(duì)目的基因進(jìn)行定量分析的PCR檢測(cè)技術(shù)。
基因表達(dá)的研究一般采用相對(duì)定量的方法。相對(duì)定量法必須對(duì)樣品的目的基因和內(nèi)參基因同時(shí)分別進(jìn)行定量,然后 得出對(duì)于內(nèi)參基因的目的基因的相對(duì)量。通過(guò)比較樣品中目的基因反轉(zhuǎn)錄之后的 DNA 量來(lái)研究不同樣品間的 mRNA 表達(dá)量情況。內(nèi)參基因通常選用 β-actin 或 GAPDH。通過(guò)同時(shí)對(duì)內(nèi)參基因的實(shí)時(shí)檢測(cè),可以對(duì)樣品之間由于起始細(xì) 胞數(shù)不同或 RNA 提取效率不同等造成的 RNA 量誤差進(jìn)行校正,達(dá)到在嚴(yán)格意義上對(duì)樣品之間的 mRNA 表達(dá)量進(jìn)行分析的目的。
雙熒光素酶實(shí)驗(yàn)
雙熒光素酶報(bào)告基因?qū)嶒?yàn)系統(tǒng)采用熒火蟲(chóng)熒光素酶和海腎熒光素酶組成雙熒光素酶報(bào)告基因?qū)嶒?yàn)系統(tǒng)。實(shí)驗(yàn)中,報(bào)告基因(熒火蟲(chóng)熒光素酶)活力的改變,與基因表達(dá)的特定實(shí)驗(yàn)條件相關(guān);而示蹤基因(海腎熒光素酶)作為內(nèi)對(duì)照,使測(cè)試不被實(shí)驗(yàn)條件變化所干擾,減少內(nèi)在的變化因素所削弱的實(shí)驗(yàn)準(zhǔn)確性,如,培養(yǎng)細(xì)胞的數(shù)目和活力的差別,細(xì)胞轉(zhuǎn)染和裂解的效率等。熒火蟲(chóng)熒光素酶和海腎熒光素酶測(cè)試的組合,提供了雙遺傳報(bào)告基因應(yīng)用的理想測(cè)試系統(tǒng)。
使用雙熒光素酶實(shí)驗(yàn)可檢測(cè)miRNA與預(yù)測(cè)靶點(diǎn)的相互作用或轉(zhuǎn)錄因子與啟動(dòng)子的相互作用。
]]>然而,流式細(xì)胞儀,不容易熟練掌握,需要在設(shè)備和技術(shù)培訓(xùn)方面進(jìn)行大量投資。
因此,對(duì)于許多研究人員而言,將流式細(xì)胞儀外包給合同研究組織 (CRO) 既具有成本效益,又是確保從他們的樣本中獲得最高質(zhì)量數(shù)據(jù)的最佳方式。
服務(wù)項(xiàng)目
a) 免疫表型 Immunophenotyping;
b) 細(xì)胞分型 Cell Sorting;
c) 受體占用 Receptor Occupancy;
d) 細(xì)胞功能檢測(cè)(凋亡、周期、ROS、線粒體膜電位)Functional Cellular Assays;
e) 細(xì)胞內(nèi)細(xì)胞因子染色I(xiàn)ntracellular Cytokine staining;
f)T細(xì)胞活化/耗竭檢測(cè) T Cell Activation/Exhaustion Assays
]]>Western Blot采用的是聚丙烯酰胺凝膠電泳,被檢測(cè)物是蛋白質(zhì),“探針”是抗體,“顯色”用標(biāo)記的二抗。經(jīng)過(guò)聚丙烯酰胺凝膠電泳(PAGE)分離的蛋白質(zhì)樣品,通過(guò)轉(zhuǎn)膜方式轉(zhuǎn)移到固相載體(如PVDF、NC膜)上,固相載體以非共價(jià)鍵形式吸附蛋白質(zhì)。以固相載體上的蛋白質(zhì)或多肽作為抗原,與對(duì)應(yīng)的抗體起免疫反應(yīng),再與酶標(biāo)記(通常是HRP)的第二抗體起反應(yīng),經(jīng)過(guò)底物化學(xué)發(fā)光試劑(如ECL)發(fā)光以檢測(cè)電泳分離的特異性目的基因表達(dá)的蛋白成分。
ELISA( Enzyme-Linked Immunosorbnent Assay ),酶聯(lián)免疫吸附測(cè)定
ELISA 是一種結(jié)合抗原、抗體特異性反應(yīng)和酶對(duì)底物高效催化作用的高敏感性免疫學(xué)實(shí)驗(yàn)技術(shù)。ELISA 的基礎(chǔ)是抗原或抗體的固相化及抗原或抗體的酶標(biāo)記。結(jié)合在固相載體表面的抗原或抗體仍保持其免疫學(xué)活性,酶標(biāo)記的抗原或抗體既保留其免疫學(xué)活性,又保留酶的活性。在測(cè)定時(shí),受檢標(biāo)本(測(cè)定其中的抗體或抗原)與固相載體表面的抗原或抗體起反應(yīng),洗滌使固相載體上形成的抗原抗體復(fù)合物與液體中的其他物質(zhì)分開(kāi),再加入酶標(biāo)記的抗原或抗體,通過(guò)反應(yīng)使其結(jié)合在固相載體上。此時(shí)固相上的酶含量與標(biāo)本中受檢物質(zhì)的量呈一定的比例。加入酶反應(yīng)的底物,底物被酶催化成為有色產(chǎn)物,產(chǎn)物的量與標(biāo)本中受檢物質(zhì)的量直接相關(guān),故可根據(jù)呈色的深淺進(jìn)行定性或定量分析。
]]>細(xì)胞增殖與細(xì)胞凋亡、細(xì)胞周期等是腫瘤研究的重要表型,是分子生物學(xué)和藥理學(xué)研究解決的問(wèn)題之一。通過(guò)在細(xì)胞中過(guò)表達(dá)或干擾某個(gè)基因研究基因?qū)?xì)胞增殖能力的影響,進(jìn)一步研究基因的功能,或?qū)?xì)胞進(jìn)行藥物處理,研究藥物對(duì)增殖的影響。
實(shí)驗(yàn)原理(CCK-8)
細(xì)胞增殖是生物體的重要生命特征,細(xì)胞以分裂的方式進(jìn)行增殖,是生物體生長(zhǎng)、發(fā)育、繁殖和遺傳的基礎(chǔ)。細(xì)胞增殖的研究方法有很多,主要包括:CCK8方法。
Cell Counting Kit-8(簡(jiǎn)稱(chēng)CCK-8)試劑可用于簡(jiǎn)便而準(zhǔn)確的細(xì)胞增殖和毒性分析。其基本原理為:該試劑中含有WST-8【化學(xué)名:2-(2-甲氧基-4-硝基苯基)-3-(4-硝基苯基)-5-(2,4-二磺酸苯)-2H-四唑單鈉鹽】,它在電子載體1-甲氧基-5-甲基吩嗪鎓硫酸二甲酯(1-Methoxy PMS)的作用下被細(xì)胞中的脫氫酶還原為具有高度水溶性的黃色甲瓚產(chǎn)物(Formazan dye)。生成的甲瓚物的數(shù)量與活細(xì)胞的數(shù)量成正比。因此可利用這一特性直接進(jìn)行細(xì)胞增殖和毒性分析。
CCK-8方法優(yōu)勢(shì):
1 操作簡(jiǎn)單,避免細(xì)胞計(jì)數(shù)過(guò)程中人為因素的影響;
2 細(xì)胞用量少,檢測(cè)靈敏度高,穩(wěn)定;
3 可反復(fù)用酶標(biāo)儀讀板,檢測(cè)時(shí)間靈活,不影響細(xì)胞進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn);
4 CCK-8產(chǎn)生的Formazan是水溶性的,無(wú)需換液,尤其適用于懸浮細(xì)胞,與MTT法相比更方便,更安全。
目的:考察目的基因?qū)?xì)胞的增殖能力產(chǎn)生的影響或藥物對(duì)細(xì)胞增殖能力的影響
材料:目的細(xì)胞、穩(wěn)轉(zhuǎn)株(空載、目的基因)
步驟:細(xì)胞收集——細(xì)胞鋪板——(藥物處理)——細(xì)胞培養(yǎng)——加入CCK-8處理,酶標(biāo)儀檢測(cè)
細(xì)胞凋亡
細(xì)胞凋亡是腫瘤和發(fā)育研究的重點(diǎn),同時(shí)也是藥理學(xué)研究的熱點(diǎn)。細(xì)胞凋亡是指細(xì)胞在一定的生理或病理?xiàng)l件下,遵循自身的程序,自主結(jié)束其生命的過(guò)程。它是一個(gè)主動(dòng)的,高度有序的,基因控制的,一系列酶參與的過(guò)程。細(xì)胞凋亡的過(guò)程大致可分為以下幾個(gè)階段:接受凋亡信號(hào)→凋亡調(diào)控分子間的相互作用→蛋白水解酶的活化(Caspase)→進(jìn)入連續(xù)反應(yīng)過(guò)程。
基本原理
細(xì)胞凋亡檢測(cè)采用Annexin V/PI雙染法檢測(cè),Annexin V是一種分子量為35~36kD的Ca2+依賴(lài)性磷脂結(jié)合蛋白,能與磷脂酰絲氨酸(Phosphatidylserine,PS)高親和力特異性結(jié)合。在細(xì)胞凋亡的早期,PS可從細(xì)胞膜的內(nèi)側(cè)翻轉(zhuǎn)到細(xì)胞膜的表面,暴露在細(xì)胞外環(huán)境中。將Annexin V 進(jìn)行熒光素(FITC) 標(biāo)記,以標(biāo)記了的Annexin V 作為熒光探針,利用流式細(xì)胞儀或熒光顯微鏡可檢測(cè)細(xì)胞凋亡的發(fā)生。
7-AAD類(lèi)似于碘化丙啶(propidine iodide,PI)是一種核酸染料,它不能透過(guò)完整的細(xì)胞膜,但在凋亡中晚期的細(xì)胞和死細(xì)胞,7-AAD能夠透過(guò)細(xì)胞膜而使細(xì)胞核紅染。因此將Annexin V 與7-AAD 匹配使用,就可以將凋亡早晚期的細(xì)胞以及死細(xì)胞區(qū)分開(kāi)來(lái)。
目的: 通過(guò)慢病毒感染獲得過(guò)表達(dá)某基因的細(xì)胞株,利用Annexin-APC和7-AAD雙染法對(duì)正常細(xì)胞、對(duì)照組細(xì)胞、基因過(guò)表達(dá)組細(xì)胞的凋亡情況進(jìn)行檢測(cè),研究基因?qū)?xì)胞凋亡的影響。
材料:質(zhì)粒與細(xì)胞株
步驟:細(xì)胞準(zhǔn)備——收集細(xì)胞——Annexin和 7-AAD/PI進(jìn)行雙染色——流式上機(jī)檢測(cè)
細(xì)胞侵襲和遷移
在腫瘤發(fā)展過(guò)程中,細(xì)胞進(jìn)入循環(huán)系統(tǒng)的能力是重要的研究對(duì)象。相關(guān)的信號(hào)通路主要可以分為控制細(xì)胞黏附和控制細(xì)胞骨架。細(xì)胞的遷移與侵襲主要與細(xì)胞骨架和黏附相關(guān)。腫瘤細(xì)胞侵襲和遷移能力的改變通常采用Transwell進(jìn)行檢測(cè)。細(xì)胞劃痕也是測(cè)定腫瘤細(xì)胞運(yùn)動(dòng)特性的方法,由于無(wú)法區(qū)別正常增殖和遷移細(xì)胞,應(yīng)用有局限性。
Transwell實(shí)驗(yàn)
Transwell小室底層的一張有通透性的膜(一般為聚碳酸酯膜),將其放置于孔板中,小室內(nèi)稱(chēng)上室,培養(yǎng)板內(nèi)稱(chēng)下室。由于聚碳酸酯膜有通透性,下層培養(yǎng)液中的成分可以影響到上室內(nèi)的細(xì)胞。應(yīng)用Transwell可研究下層培養(yǎng)液中的成分對(duì)細(xì)胞生長(zhǎng)、運(yùn)動(dòng)等的影響
腫瘤遷移實(shí)驗(yàn):研究腫瘤細(xì)胞的遷移能力或特定情況下腫瘤細(xì)胞的遷移能力。常用8.0、12.0μm膜,上室種腫瘤細(xì)胞,下室加入FBS或某些特定的趨化因子,腫瘤細(xì)胞會(huì)向營(yíng)養(yǎng)成分高的下室跑,計(jì)數(shù)進(jìn)入下室的細(xì)胞量可反映腫瘤細(xì)胞的遷移能力。
腫瘤侵襲實(shí)驗(yàn):研究腫瘤細(xì)胞的侵襲能力或特定情況下腫瘤細(xì)胞的侵襲能力。在聚碳酸酯膜上涂上一層基質(zhì)膠,模仿細(xì)胞外基質(zhì),上室種腫瘤細(xì)胞,下室加入FBS或某些特定的趨化因子,細(xì)胞要把基質(zhì)消化后才可以從上室遷移到下室,計(jì)數(shù)進(jìn)入下室的細(xì)胞量測(cè)定細(xì)胞的侵襲能力。
目的: 研究目的基因過(guò)表達(dá)/干擾對(duì)細(xì)胞侵襲、轉(zhuǎn)移能力的影響
材料:正常細(xì)胞、對(duì)照慢病毒、過(guò)表達(dá)基因慢病毒
步驟:細(xì)胞復(fù)蘇——Transwell鋪板——細(xì)胞培養(yǎng)及染色——拍照
劃痕實(shí)驗(yàn)原理
腫瘤細(xì)胞在體外仍具有遷移的能力。細(xì)胞劃痕法是測(cè)定了腫瘤細(xì)胞的運(yùn)動(dòng)特性的方法之一。其借鑒體外細(xì)胞致傷愈合實(shí)驗(yàn)?zāi)P?,在體外培養(yǎng)的單層細(xì)胞上,劃痕致傷,然后比較不同實(shí)驗(yàn)組中腫瘤細(xì)胞遷移的能力。
目的: 使用篩選的穩(wěn)定株(轉(zhuǎn)對(duì)照病毒、過(guò)表達(dá)基因病毒),通過(guò)對(duì)空細(xì)胞、對(duì)照穩(wěn)轉(zhuǎn)、目的基因穩(wěn)轉(zhuǎn)三組細(xì)胞進(jìn)行劃痕寬度進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,研究基因?qū)?xì)胞遷移能力的影響。
材料:病毒和細(xì)胞株,目的細(xì)胞來(lái)源于客戶(hù),穩(wěn)定株和元構(gòu)建
步驟:細(xì)胞鋪板——?jiǎng)澗€——細(xì)胞培養(yǎng)及拍照——統(tǒng)計(jì)分析
細(xì)胞周期檢測(cè)
細(xì)胞周期(cell cycle)是指細(xì)胞從一次分裂完成開(kāi)始到下一次分裂結(jié)束所經(jīng)歷的全過(guò)程,分為間期與分裂期兩個(gè)階段。細(xì)胞周期反應(yīng)了細(xì)胞增殖速度,單個(gè)細(xì)胞的周期測(cè)定可采用縮時(shí)攝影的方法,但它不能代表細(xì)胞群體的周期,故現(xiàn)多采用其他方法測(cè)群體周期。
原理
細(xì)胞周期各時(shí)相的DNA含量不同,通常正常細(xì)胞的 G0/G1期具有二倍體細(xì)胞的DNA 含量(2N),而G2/M期具有四倍體細(xì)胞的DNA含量(4N),而S期的DNA含量介于二倍體和四倍體之間。PI 即碘化丙錠,可以與細(xì)胞內(nèi)DNA 和RNA 結(jié)合,采用RNA酶將RNA消化后,通過(guò)流式細(xì)胞術(shù)檢測(cè)到的與DNA 結(jié)合的PI 的熒光強(qiáng)度直接反映了細(xì)胞內(nèi)DNA含量的多少。
因此,通過(guò)流式細(xì)胞術(shù)PI染色法對(duì)細(xì)胞內(nèi)DNA含量進(jìn)行檢測(cè)時(shí),可以將細(xì)胞周期各時(shí)相區(qū)分為 G0/G1期,S 期和G2/M期,并可通過(guò)特殊軟件計(jì)算各時(shí)相的百分率。
目的: 通過(guò)慢病毒感染獲得基因過(guò)表達(dá)的細(xì)胞株,利用PI染色法結(jié)合流式細(xì)胞術(shù)檢測(cè)各組細(xì)胞周期的變化。從而研究目的基因?qū)?xì)胞周期的影響。
材料:目的細(xì)胞、病毒
步驟:細(xì)胞準(zhǔn)備——樣品收集——上機(jī)檢測(cè)——數(shù)據(jù)分析
克隆形成實(shí)驗(yàn)
原理
單個(gè)細(xì)胞在體外增殖6代以上(時(shí)間約1周以上),其后代所形成的細(xì)胞群體,稱(chēng)為集落或克隆。每個(gè)克隆含有50個(gè)以上的細(xì)胞,大小在0.3 – 1.0mm之間。細(xì)胞接種存活率只表示接種細(xì)胞后貼壁的細(xì)胞數(shù), 但貼壁后的細(xì)胞不一定每個(gè)都能增殖并形成克隆。只有同時(shí)具有貼壁和增殖活力的細(xì)胞才會(huì)形成克隆??寺⌒纬陕史从臣?xì)胞的獨(dú)立生存能力的強(qiáng)弱,用于評(píng)價(jià)細(xì)胞群體依賴(lài)性和增殖能力。由于細(xì)胞生物學(xué)性狀不同,細(xì)胞克隆形成率差別也很大,一般初代培養(yǎng)細(xì)胞克隆形成率弱,傳代細(xì)胞系強(qiáng); 二倍體細(xì)胞克隆形成率弱,轉(zhuǎn)化細(xì)胞系強(qiáng);正常細(xì)胞克隆形成率弱,腫瘤細(xì)胞強(qiáng)??寺⌒纬陕逝c接種密度有一定關(guān)系,做克隆形成率測(cè)定時(shí),接種細(xì)胞一定要分散成單細(xì)胞懸液,直接接種在培養(yǎng)皿中,持續(xù)一周以上,隨時(shí)檢查,到細(xì)胞形成克隆時(shí)終止培養(yǎng)。
目的:通過(guò)目的基因過(guò)表達(dá)/干擾細(xì)胞組、空細(xì)胞組與陰性對(duì)照組(空病毒)克隆形成數(shù)量的統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,研究基因?qū)?xì)胞群體依賴(lài)性和增殖能力的影響。
材料:病毒和細(xì)胞株
步驟:鋪板——細(xì)胞培養(yǎng)——觀察克隆,染色,計(jì)算克隆形成率
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