在腫瘤研究上,可以先使用ATGC、GEO數(shù)據(jù)庫分析病例組與對照組之間的基因表達差異,進行生存分析,以確定您感興趣的基因在臨床上確實有意義。同時,這些基礎(chǔ)的生信分析工作還可以幫助您合理地設(shè)計您的實驗方案。
腫瘤研究的實驗通常包括三個部分:臨床研究、細胞研究和動物實驗。
臨床研究,首先要考慮的是可以收集到的病例數(shù)以及收集的難度。除了記錄好臨床數(shù)據(jù),根據(jù)實驗的內(nèi)容,需要對臨床樣品進行合適的保存和記錄。如免疫組化、免疫熒光樣品,需要用PBS洗去血液后,固定常溫保存。RT-qPCR和WB樣品,則需要速凍保存。務(wù)必先弄清楚樣品保存條件后,再開展工作,否則可能白辛苦。而且由于臨床樣品收集是非常省時的工作,一旦錯誤收集樣品,可能導(dǎo)致這部分實驗無法在特定時間點前完成。
細胞實驗,首先需要查收是否有可靠來源的細胞株,細胞株是否易于培養(yǎng)和實驗。設(shè)計好細胞實驗內(nèi)容后,需要確定基因在細胞的表達水平,以確定是過表達還是沉默該基因。
如果要做裸鼠成瘤實驗,那么在選擇細胞時,還需要確定細胞的成瘤性。
總之,在您開始長達1年甚至數(shù)年的研究之前,我建議您,先花1-2個月做這些前期工作。